יהודית היא ממייסדי "שטופים", מרכז השואף לחזק את החברה האזרחית על ידי פיתוח מינהל חברתי, יצירת תחומי השפעה לאומיים, ניהול שולחנות עגולים משולשים ועוד. בנוסף, יהודית משקיעה מאמצים להרחבת הפילנתרופיה הפרטית. במסגרת זו היא שותפה פעילה בקבוצת "מחויבים לתת" - יוזמה לקידום הפילנתרופיה בישראל, וחברה ברשת המממנים היהודית (JFN) ואריה יהודה (אריה יהודה) ישראל) לקידום פילנתרופיה של נשים. בעלת הכשרה מקצועית כמטפלת באמנות ובוגרת תכנית לסלי קולג 'בבוסטון, היא גם אם לשלוש בנות וסבתא לשמונה נכדים.

יהודית יובל רקנאטי היא יזם מוביל ופעילה חברתית, המחויבת לחיזוק החברה הישראלית.

בשנת 1998, בשיתוף עם ד"ר יוסי הדר המנוחה, ייסדה יהודית יובל רקנאטי את נט"ל - המרכז הישראלי לטראומה לנפגעי טרור ומלחמה, ארגון ללא כוונת רווח שמטרתו להיות מרכז טיפול רב-תחומי לנפגעי טראומה של טרור ומלחמה, ומשפחותיהם, שבהן היא מכהנת כיו"ר פעיל. בשנת 2004, יחד עם בעלה המנוח, ד"ר ישראל (רולי יובל ושלוש בנותיהם) הקימו קרן פילנתרופית משפחתית - קרן גנדיר - שהוקמה מתוך רצון לסייע לחזק את החברה הישראלית על ידי התמקדות בתמיכה טיפוח ארגונים חברתיים אזרחיים והדגשת קידומם של בני הנוער בישראל לקראת השתלבותם כמבוגרים בחברה, ואחד הדברים המניעים אותה הוא שגורם לאנשים רבים ככל האפשר לתרום את כספם וזמנם למען החברה הישראלית.